À Secretaria de Saúde incumbe manter os serviços de assistência primária em saúde, através de equipe multidisciplinar no Município de Irati curativa e preventivamente; a administração e manutenção da rede municipal de saúde (postos de saúde, ambulatório e Centro de Saúde); fiscalizar o cumprimento das posturas referentes ao poder de polícia de higiene pública; a execução das atividades relacionadas à vigilância sanitária, inclusive em relação aos óbitos do Município de Irati, que devem ser controlados pelo Departamento de Vigilância e Saúde; manter convênios com a União e o Estado para a execução de campanhas e programas de saúde pública, de imunização e de combate a epidemias; desempenhar as atividades do Município no âmbito do Sistema Único de Saúde; gerir e administrar o Fundo Municipal de Saúde nos termos do disposto na legislação que o instituiu.